學校由原舟山市職教中心、舟山市經貿學校、舟山市汽校、定海區農技學校四校合并而成，于1999年4月正式掛牌成立。

2000年6月被評為省一級重點職校，2002年7月被教育部、勞動與社會保障部、國家經貿委評為全國職業教育先進單位。2003年11月被評為首批國家級重點中等職校，2004年11月被省教育廳、發展改革委、經貿委、勞動和社會保障廳確定為浙江省首批先進制造業技能型人才培養培訓示范基地，2007年被授予全國教育系統先進集體、國家級實訓基地、全國班級先進集體、省綜合性公共實訓基地，2009年獲得浙江省禁毒教育示范學校、浙江省創建學習型先進集體、浙江省中職學校30強、浙江省首批中等職業教育課程改革基地學校等榮譽稱號。學校還是省教科研先進集體、省優秀農村預備勞動力培訓基地、省級現代教育技術實驗學校、省青年志愿服務杰出集體稱號、舟山市首批教育現代化學校、通過ISO9001 國際質量管理體系認證。是舟山市規模最大、設備師資最優、項目最全的綜合性中等職業技能培訓基地。

2003年8月，舟山市教育局、舟山職業技術學校、浙江金鷹集團有限公司、浙江揚帆船舶集團有限公司、浙江弘生集團共同出資發起組建了職業教育聯合體－－舟山職業教育集團，成為舟山市政府2003年百大實事工程之一。集團圍繞國家級實訓基地、省級綜合性公共實訓基地、省級先進制造業技能型人才培養培訓示范基地、省優秀農村預備勞動力培訓基地、省陽光工程培訓基地、舟山市職業技能培訓中心。集團以資產、專業建設、人才培養為紐帶，實行校企緊密合作、資源共享，開展職業教育和技能培訓，為企業培養適應現代企業發展的技術熟練的高素質員工。

2010年10月，浙江省人力資源和社會保障廳批準開辦全日制省級重點技工學校-----舟山市技工學校。該校隸屬于舟山市教育局和市人力資源和社會保障局共同管轄。學校在舟職技校部分專業的基礎上通過整合中國水產舟山海洋漁業公司職業技術學校（簡稱“舟漁技校”）、中國人民解放軍第4806工廠職業技術學校（簡稱“4806技?！保Ｔ撔Ｅc舟職技校實行合署辦公。

2011年，為適應海洋經濟發展要求，市政府整合舟山海洋漁業公司技校、海軍4806工廠技校，成立舟山市技工學校，與舟山職業技術學校實行兩塊牌子、一套班子，共享辦學資源。2012年學校通過省重點技工學校驗評，2014年獲批舟山技師學院（籌）。 [2]