上海醫藥職工大學始建于1939年，是經上海市人民政府批準為醫藥衛生事業培養應用型高級專業人才的公辦成人高等專科學校。建校七十余年來，在長期的教學實踐中，學校形成了“加強基礎教學、強化能力培養、注重實踐、學風嚴謹”的辦學特色，為上海乃至全國的醫藥和衛生事業培育輸送了眾多優秀人才。

上海醫藥職工大學是醫藥行業的中、高級專業技術人員的培訓基地，是國家藥品監督管理局指定的執業藥師培訓中心之一，擔負著上海地區執業藥師的考前培訓和以后的繼續教育工作。學校以其一流的培訓質量、居高的合格率享譽業內外。 學校被國家社會勞動保障部列為藥學技術人員的高職職業資格鑒定考核單位。

上海醫藥職工大學位于市中心的長寧區愚園路1088弄48號，在楊浦區武東路和浦東新區匯南鎮設立了包括位于上海的東部及中部地區的共計五個校區。學校擁有圖書館、閱覽室、實驗室、語音室、微機房、多媒體教室和學術演講廳。學校藏書15萬余冊并保存著1907年至今的全套美國化學文摘2500余冊。