徐州生物工程學校創建于1956年，前身為江蘇省徐州農業學校，2002年經江蘇省人民政府批準，更名為江蘇省徐州生物工程學校，2003年升格為現校。

是聯合國教科文組織“環境、人口與可持續發展” 教育項目實驗學校，印度國家信息學院（NIIT）合作辦學單位，首批國家級重點職業學校，國家級職業技能鑒定站。江蘇省高水平示范職業學校，江蘇省技能型緊缺人才培訓基地。02年以來，學校先后獲得“江蘇省職業教育先進單位”（兩次）、“江蘇省教育回報社會先進單位”、“江蘇省園林式單位”、“徐州市文明單位”、“徐州市扶貧攻堅先進單位”、“廉潔徐州創建先進單位”、“徐州市教育系統黨建工作先進集體”、“徐州市未成年人思想道德建設先進單位”等榮譽稱號。