皖南醫藥衛生學校由原蕪湖地區衛生學校更名而來，始建于1973年，是安徽省以口腔、護理專業為特色的國家普通中等專業學校。

2008年8月經市政府批準，蕪湖地區衛校與宣城職業技術學院合并，保留蕪湖地區衛校整體建制。2010年宣城職業技術學院以蕪湖地區衛校為基礎設置護理系，2016年9月，蕪湖地區衛校搬遷至宣城職業技術學院校區，2017年5月經市政府批準，“蕪湖地區衛生學校”正式更名為“皖南醫藥衛生學校”。目前宣城職業技術學院護理系現設有護理、助產、口腔醫學技術3個專業，計3500余人；皖南醫藥衛生學校現設有護理、口腔修復工藝2個專業，在廣德、寧國、宣州區設立了3個教學點，共有學生920余人，其中本校學生294人。

附屬口腔醫院為二級口腔醫療機構，現有醫護人員33人，內設科室7個，椅位22張，床位16張，租用場地位于蕪湖市康復路，建筑面積約1280平方米。

2017年8月，經市政府批準，皖南醫藥衛生學校新校區選址位于圣俞路與桂花路交叉口西南角，宣城職業技術學院建成區東北側，規劃用地面積約34.78公頃。

皖南醫藥衛生學校全面貫徹黨的教育衛生工作方針，堅持“德育為首、教學為主、育人為本、就業為先”的辦學宗旨，嚴謹治校、科學管理，注重學生德智體美全面和諧發展，在省內外享有較高的知名度和良好聲譽。